Eppendorf Mastercycler pro is optimaal geschikt voor high throughput. Er kunnen tot 30 units met één computer bediend worden. Geavanceerde CycleManager pro software biedt de mogelijkheid vanaf elke computer in het lokale netwerk PCR te monitoren.
Beheerdersfuncties, wachtwoordbeveiliging, individuele gebruikersmappen, heldere software met informatie over de lopende PCR’s en een import/export-functionaliteit maken deel uit van de opties van het softwarepakket. De software is zeer geschikt om te gebruiken in een Good Laboratory Practice (GLP)-omgeving.
De verzamelde gegevens worden in een database gearchiveerd. Op alle 30 units kunnen verschillende protocollen gelijktijdig uitgevoerd worden – dit zorgt voor grote flexibiliteit.