Wil je de basisbegrippen leren die binnen bio-informatica gebruikt worden? Een beeld krijgen van welke soorten onderzoek er gedaan kunnen worden met bio-informatica? Weten hoe je online beschikbare software kan gebruiken voor een eerste analyse? Dan is deze cursus iets voor jou!
Programma van deze cursus
Dag 1: Basis in concepten binnen biologie en informatica die relevant zijn voor bioinformatica
- Hoe vertalen we de biologie van een cel naar datapunten en hoe zien die data er dan uit?
- Waar haal je data vandaan? Hoe kun je hier relevante informatie uithalen? En hoe kun je data en informatie combineren om kennis op te bouwen? (NCBI, SRA, EMBL-EBI, OMIM)
Dag 2: Basis in programmeren voor bioinformatici (Bash/Python/R)
- Waarom kies je voor een specifieke programmeertaal?
- Wat kun je met een programmeertaal in een biologische context?
- De beginselen van programmeerconcepten (Wat zijn variabelen, datastructuren, loops, conditional statements en functies?)
- Wat is een pipeline en hoe werkt het aan elkaar schakelen van programma’s?
Dag 3: Basis in sequentieanalyse van DNA, RNA en eiwit en diverse alignmenttools (needle, Clustal Omega, MUSCLE, MAFFT)
- Wat vertellen Multiple Sequence Alignments ons over sequenties? & Hoe vertalen we datapunten terug naar de biologie van een cell
Dag 4: Basis in genomics, transcriptomics en algehele data visualisatie
- Hoe zoeken we naar de oorzaak van een genetische ziekte, zoals kanker?
- Hoe bekijken we wat de mogelijke invloed van verschillende condities is op de expressie van genen?
- Hoe bekijken we genetische informatie?
Voor wie is de cursus Basis in de Bio-informatica?
Deze cursus is met name bedoeld voor professionals die in de biologie/life sciences werken. Denk hierbij aan analisten, biotechnologen, biobased productontwikkelaars, celbiologen, (basis-)artsen, (klinisch-)genetici, veredelaars en fytopathologen. Uiteraard is de cursus ook geschikt voor eenieder die geïnteresseerd is in een kennismaking met bio-informatica.
Mocht je al ervaring hebben met programmeren óf met moleculaire biologie of genetica, dan is deze training uitermate geschikt als je een eerste stap wil zetten in bio-informatica met Python.
De cursus bevat 4 cursusdagen van 09:30-16:15