Onderzoekers van de TU Delft hebben een test ontwikkeld voor het opsporen van specifieke stukjes genetisch materiaal waarmee virussen als het coronavirus, en antibioticaresistente bacteriën snel en goedkoop met het blote oog kunnen worden gedetecteerd. De resultaten zijn gepubliceerd in Biophysical Journal. De methodiek is deels gebaseerd op eiwitten uit het CRISPR-Cas-systeem. In plaats van het Cas9-eiwit, het meest gebruikte instrument voor genbewerking, passen de Delftse onderzoekers de Cas-eiwitten ‘Cas12a en Cas13a’ toe. Die hebben als voordeel dat ze, als ze bij een zoektocht een specifiek stukje DNA of RNA vinden, ál het aanwezige DNA of RNA aan stukken knippen. Om de activiteit van deze actieve CRISPR- eiwitten met het blote oog uit te lezen, maakt de test gebruik van het natuurkundige fenomeen ‘Liquid-Liquid Phase Separation (LLPS)’. Een fenomeen te vergelijken met het schudden van olie en water, waarbij de olie vloeibare druppeltjes vormt die gescheiden blijven van het water. Voor deze methode maken de onderzoekers gebruik van positief geladen moleculen. Toegevoegd aan een monster waarin lange strengen DNA of RNA zitten, treedt er een fasescheiding op omdat DNA en RNA van nature negatief geladen zijn. De positief geladen moleculen en het DNA of RNA zoeken elkaar dan op.

TU DelftcoronaCRISPR-Cas