Wil je de basisbegrippen leren die binnen bio-informatica gebruikt worden? Een beeld krijgen van welke soorten onderzoek er gedaan kunnen worden met bio-informatica? Weten hoe je online beschikbare software kan gebruiken voor een eerste analyse? Dan is deze cursus iets voor jou!
Programma van deze cursus
Dag 1: Basis in concepten binnen biologie en informatica die relevant zijn voor bioinformatica
- Hoe vertalen we de biologie van een cel naar datapunten en hoe zien die data er dan uit?
- Waar haal je data vandaan? Hoe kan je hier relevante informatie uithalen? En hoe kan je data – en informatie combineren om kennis op te bouwen? (NCBI, SRA, EMBL-EBI, OMIM)
Dag 2: Basis in programmeren voor bioinformatici (Bash/Python/R)
- Waarom kies je voor een specifieke programmeertaal?
- Wat kan je met een programmeertaal in een biologische context?
- De beginselen van programmeer concepten (Wat zijn variabelen, data-structuren, loops, conditional statements en functies?)
- Wat is een pipeline en hoe werkt het aan elkaar schakelen van programma’s?
Dag 3: Basis in sequentie-analyse van DNA, RNA en eiwit en diverse alignment tools (needle, Clustal Omega, MUSCLE, MAFFT)
- Wat vertellen Multiple Sequence Alignments ons over sequenties? & Hoe vertalen we data punten terug naar de biologie van een cell
Dag 4: Basis in genomics, transcriptomics en algehele data visualisatie
- Hoe zoeken we naar de oorzaak van een genetische ziekte, zoals kanker?
- Hoe bekijken we wat de mogelijke invloed van verschillende condities is op de expressie van genen?
- Hoe bekijken we genetische informatie?
Voor wie is de cursus Basis in de Bio-informatica?
Deze cursus is met name bedoeld voor professionals die in de biologie/life sciences werken. Denk hierbij aan analisten, biotechnologen, biobased productontwikkelaars, celbiologen, (basis-)artsen, (klinisch-)genetici, veredelaars en fytopathologen. Uiteraard is de cursus ook geschikt voor eenieder die geïnteresseerd is in een kennismaking met bio-informatica.
Mocht je al ervaring hebben met programmeren óf met moleculaire biologie of genetica, dan is deze training uitermate geschikt als je een eerste stap wil zetten in bioinformatica met Python.
De cursus bevat 4 cursusdagen van 09:30-16:15