Waar Next Generation Sequencing (NGS) voorheen voorbehouden was aan gespecialiseerde onderzoekscentra, vindt de techniek razendsnel haar weg naar reguliere klinische, industriële en diagnostische laboratoria. Sequencers worden compacter, sneller en betaalbaarder. Maar hoe zorg je ervoor dat jouw lab de stap naar NGS succesvol zet en de opgewekte databerg correct interpreteert?
Of het nu gaat om het opsporen van zeldzame genetische mutaties, microbiologische typering of gepersonaliseerde geneeskunde: het compleet in kaart brengen van DNA en RNA is niet langer een toekomstscenario, maar een dagelijkse realiteit. Waar traditionele Sanger-sequencing tot enkele tientallen DNA-fragmenten per keer analyseert, genereert NGS miljoenen tot miljarden sequenties parallel.
De nieuwste generatie apparatuur vraagt minder fysieke ruimte en de kosten per run zijn drastisch gedaald. Dat opent de deur voor heel wat laboratoria die voorheen afhankelijk waren van externe faciliteiten. Toch brengt de implementatie van NGS in het eigen lab een cruciale uitdaging met zich mee: de kwaliteit van je analyse valt of staat met een vlekkeloze monsterpreparatie en inzicht in het sequenceproces.
“Een goed NGS-experiment begint niet bij het apparaat, maar bij de keuzes die je vooraf maakt in je sample preparation.”
— dr. Ken Kraaijeveld, docent Bio-informatica en NGS-expert –
“In veel labs zie je dat NGS-apparatuur wordt aangeschaft als een soort ‘black box’: de monsters gaan erin, en aan het einde rolt er een bestand uit,” vertelt evolutionair bioloog en docent Ken Kraaijeveld, auteur van het handboek ‘DNA aflezen met Next Generation Sequencing‘. “Maar als er in de voorbewerking of de library preparatie iets misgaat, beïnvloedt dat direct je data. Het herkennen van ruis, het begrijpen van coverage en het selecteren van het juiste sequencingplatform zijn essentieel om betrouwbare resultaten te garanderen.”
Daarnaast is de markt voor sequencers diverser dan ooit. Kies je voor de beproefde short-read technologieën van Illumina, of bieden long-read systemen meer meerwaarde voor jouw specifieke toepassingen?
Om laboratoriumprofessionals, analisten en medisch deskundigen snel en praktisch wegwijs te maken in deze dynamische technologie, organiseert het Centrum Bioscience en Diagnostiek (CBD) van Hogeschool Leiden de eendaagse cursus Introductie Next Generation Sequencing (NGS). Tijdens deze interactieve nascholingsdag wisselen theorie en praktijkgerichte opdrachten elkaar af. Cursisten duiken onder meer in:
Een uniek onderdeel van de dag is de ruimte voor eigen casuïstiek: deelnemers kunnen vragen of vraagstukken uit hun eigen laboratoriumpraktijk direct voorleggen aan de docent en vakgenoten.
Wil je als laboratoriummedewerker of arts vol vertrouwen aan de slag met NGS of uitslagen beter kunnen interpreteren? Binnen één dag ben je op de hoogte van de belangrijkste principes, workflows en kwaliteitscontroles.
Liever een incompany- of maatwerktraject voor jouw complete team? Neem vrijblijvend contact op met het CBD.
Bekijk het volledige programma en meld je direct aan op de website van Hogeschool Leiden
