Het bepalen van een compleet genoom of juist gericht op zoek naar mutaties daarin; nu NGS apparaten steeds kleiner en goedkoper worden, is deze techniek voor allerlei laboratoria bereikbaar geworden. Tijdens deze introductiecursus leer je verschillende sequencers die op de markt zijn kennen, behandelen we wat de voor- en nadelen van elk apparaat zijn en gaan we in op de monsterpreparatie van de meest gebruikte sequencers. We gaan in op controles en kwaliteit van de data, en geven voorbeelden van wat er met de data onderzocht kan worden.
Voor wie
Laboratoriummedewerkers die NGS (willen gaan) gebruiken, of artsen die met NGS-uitslagen werken. Minimaal hbo werk- en denkniveau.
Wat je leert
Tijdens deze cursus wisselen theoriecolleges en opdrachten elkaar af. Je leert:
- De basisbegrippen die nodig zijn om de techniek te begrijpen: target DNA, read, oligo, adaptor, cluster density, coverage, library, VCF, bridge amplification, multiplexen, fastq, paired-end;
- Hoe de monsterpreparatie voor een Illumina-sequencing werkt;
- Wat het doel en de kritische factoren van de stappen van NGS zijn;
- De manier van basebepaling van meerdere NGS-sequencemethoden;
- De voor- en nadelen van de verschillende technieken;
- Hoe de kwaliteit van sequenceresultaten wordt gemeten;
- Welke controles worden meegenomen bij een NGS en hoe deze worden beoordeeld;
- Welke invloed de verschillende monsterpreparatiestappen hebben op de kwaliteit;
- Wat de toepassingen van NGS kunnen zijn.
Meer informatie over data, prijs en programma vind je op onze website.