Leer overal DNA sequencen met de MinION! Met het draagbare systeem van Oxford NanoPore Technologies (ONT) kun je op locatie real-time sequencen, zonder grote apparaten of rekenclusters. Altijd al nieuwsgierig geweest en nu klaar om de MinION in je lab te gaan gebruiken?
Tijdens deze 2,5 daagse cursus doorlopen we een volledig sequencing experiment met het ONT systeem. Na de nodige achtergrond duiken we het lab in, en op de laatste dag analyseren we de data.
Voor wie
Laboratoriumanalisten die met ONT systemen werken of willen gaan werken. Deze cursus is op HBO werk- en denkniveau.
Wat je leert
Tijdens deze gecombineerde theorie/praktijkcursus worden achtergronden, mogelijkheden en toepassingen van DNA sequencing met een MinION behandeld.
Theorie:
- Werking en gebruik nanopore sequencining
- Mogelijke toepassingen nanopore sequencing en vergelijking met andere sequencing platformen
- Overwegingen bij DNA isolatie voor nanopore sequencining
- Sample preparatie
- Verschillende producten ONT en hun mogelijkheden
Labpraktijk:
- Quality Control MinION flowcellen
- Quality control DNA sample
- Bead zuivering
- Library prep uitvoeren voor nanopore sequencing
- QC met de Qubit
- Poolen van meerdere samples voor analyse
- MinION software instellen en gebruiken
- Library laden
- MinION runnen
- Real-time voortgang bekijken: data productie en basecalling
- Troubleshooting mogelijkheden tijdens de run
Computerpraktijk
- Run bekijken in ONT analysedashboard
- Beperkte data-analyse met focus op datakwaliteit
- Biologische conclusie trekken uit de data met Galaxy
Deze cursus is in samenwerking met Oxford Nanopore Technologies tot stand gekomen. Beeld: Oxford Nanopore Technologies.
Meer informatie over data, prijs en programma vind je op onze website.